蒙古黑石材由于本身存在著微孔，所以具有天然的透氣性，而保持蒙古黑石材自然的透氣性是至關重要的。
不同質地石材的微孔大小是不同的，石材的透氣性的高低通常是由這些微孔的大小來決定的。保持石材這些微孔的暢通，石材內部的濕氣才會揮發出來，石材由于潮濕的原因出現問題的機會就會比較少。但是正是石材這些微孔產生的毛細作用，會使石材有著不同的吸水率，石材表面上的水和液體污物也會滲入石材內對石材產生損害和污染。
對于蒙古黑石材來講，過多的與水接觸則是導致石材出現病變和損壞的主要原因，所以如何使石材既保持良好的透氣性，又能避免液體滲入石材內部，這是做好石材保護的一個重要課題和內容。