無菌室內的地面、墻壁必須平整，不易藏污納垢，便于清洗。工作臺的臺面應該處于水平狀態。無菌室和緩沖間都裝有紫外線燈，無菌室的紫外線燈距離工作臺面 1 米。工作人員進入無菌室應穿滅過菌的服裝，戴帽子。
在條件較困難的地方，也可以用木制無菌箱代替超凈臺。無菌箱結構簡單，便于移動，箱正面開有兩個洞，不操作時用推拉式小門擋住，操作時可以將雙臂伸進去。正面上部裝有玻璃，便于在內部操作，箱內部裝有紫外線燈，從側面小門可以放進去器具和菌種等。
接種針每次使用前后，必須通過火焰燃燒，待冷卻后，方可接種培養物 。帶有菌液的吸管、試管等器皿應浸泡在盛有5%的來蘇兒溶液的桶內，24h 取出沖洗;培養皿則需在高壓器中重新后方可處理營養基，切記不要直接沖入下水道中，防止阻塞。如有菌液灑在桌上或地上，應立即用 5%石碳酸溶液或 3%的來蘇兒傾覆在被污染處至少 30min，再做處理，工作衣帽等受到菌液污染時，應立即脫去，高壓蒸汽后洗滌 。
準備工作
1． 先進行無菌室空間的，開啟紫外燈30—60分鐘
2． 檢驗用的有關器材， 搬入無菌室前必須分別進會
3． 操作人員必須將手清洗，穿戴好無菌工作衣、帽和鞋，才能進入無菌室
4． 進入無菌室后再一次手部，然后才進行檢驗操作
