三格式化糞池是由三個相互連通的密封糞池組成，糞便由進糞管進入池依此順流至第三池，其各池的主要原理：
池
主要截留含蟲卵較多的糞便，糞便經發酵分解，松散的糞塊因發酵膨脹而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的糞皮、中層的糞液和下沉的糞渣。利用寄生蟲的比重大于糞尿混合液的原理使其自然沉降于化糞池底部。利用糞液的浸泡和翻動化解糞塊使其液化并截留糞渣于池底。厭氧發酵：化糞池的密閉厭氧環境，可以分解蛋白性有機物，并產生氨等物質，這些物質具有殺滅寄生蟲卵及病菌的作用。
、二池的有效容積
應根據使用人數、糞便貯存發酵達到無害化所需的時間決定，一般要求、第二池的有效容積應保證糞便在其中能存留30天時間，在第三池存留30天。每人每天的糞尿排泄量約為1.5L，節水型便器的沖洗水量可按每天2.OL計算，所以、二池容積的計算量不能少于3.5L。第三池容積的大小視用周期而定，一般不小于和第二池之和。如果是水沖式的戶廁則貯糞池容積可適當放大。
糞便轉運站(場、碼頭)設施應完好、整潔。轉運的糞污水應密閉貯存于貯糞池內。貯糞池應符合防滲漏、防臭氣擴散和防蠅的要求，并設置防火、防爆設施。
貯糞池內的糞便應及時轉運，不得外溢。
輸糞管道應完好、暢通，閘閥應嚴密，無破損、滴漏。
轉運作業時，糞便不得污染水體和作業場地。沖洗作業場地的污水應經適當處理，排入污水管網或收集池，不得直接排入附近水體。
將人力收集車的糞便轉運到機動車時，應保持轉運作業的緊密銜接，不得任意將糞罐、糞桶、手推糞車停放在主要道路上。
卸糞時應謹慎操作，不得將糞便潑灑在卸糞口周圍地面。作業結束，應及時清洗卸糞口及作業場地。
糞便轉運站(場、碼頭)應有滅蠅措施。在可視范圍內，蒼蠅不超過3只/次，無蛆，臭味不超過4級。