第二池
起進一步發酵、沉淀作用，與池相比，第二池的糞皮和糞渣的數量減少，因此發酵分解的程度較低，由于沒有新糞便的進入，糞液處于比較靜止狀態，這有利于漂浮在糞池中的蟲卵繼續下沉。
第三池
主要起儲存糞液的作用。經前二格處理的糞液進入第三池，基本上已經不含寄生蟲卵和病原微生物，達到了糞便無害化要求，可以供農田直接施肥。
寄生蟲卵一般都集中在糞皮和糞渣中，因此，過糞管位置要放在寄生蟲卵較少的中層糞液。過糞管位置較好的設置應分別斜插安裝在兩堵隔墻上：其中池到第二池過糞管下端位置在池的下1/3處，上端在第二池距池頂100mm左右：第二池到第三池過糞管下端位置在第二池的下端1/3或中部1/2處、上端在第三池距池頂100左右，過糞管與隔墻的水平夾角應呈60度。
建造要點
（一）防滲漏
（二）過糞管主要材料為：水泥管、陶管或塑料管，按要求安裝成//型、倒L型或倒T型，安裝完成后用摻5%防水粉的1：2水泥砂漿封口。
（三）糞池砌體安裝完成后，應先將糞池蓋蓋好，再回填土并分層夯實。
（四）糞池的上沿要高出地面150mm，防止雨水流入化糞池。
（五）池蓋大小要適宜，便于出糞清渣的開啟。
（六）廁屋的位置應選在廚房的下風向。
（七）在廁屋內安裝排氣通風設備
化糞池一般有三個井蓋，每個井蓋上都有兩個小洞，我們得把每個井蓋上的小洞打開后在隔半個小時或者一個小時。
再用鐵鉤把井蓋打開，打開后在用消防水往每個井口里沖洗半個小時左右。這樣能使化糞池里的沼氣減少很多。
再用一根長度為5米左右的竹竿往化糞池里插，得到化糞池里的污物和污水的深度。
若是化糞池里的深度超過1.5米，我們就得用比化糞池還深1米左右的竹梯或者其它梯子放到化糞池里。