擔保公司保函的取得較為容易，費用也較低，但由于其本質為商業信用擔保，所以公信力較低。另外，公司保函大多有很強烈的地域特色，某一地區被承認的擔保公司多是由當地相關部門如建委等批準，因而其出具的保函也只在本地區內被承認。
銀行保函，由于其出具方的專業金融性質和實質擔保的能力更強以及其銀行信用等特點，因而公信力較擔保公司出具的保函更強。所以，許多大型的工程招標過程中，甲方會指定要求乙方出據銀行保函而非擔保公司保函。與之相對應的是，銀行保函的取得過程相對公司保函而言要求更為嚴格，最基本的要求是被保證方必須在保證銀行方有足夠的授信額度，如果沒有授信額度則需要有不低于被保額度的存款準備，并且該存款在保函有效期內不可被動用。
目前國內銀行保函大多用擔保公司在銀行授信開出，能開銀行履約保函的，基本上只有建行，平安，光大等。部分招標文件要求開到基本戶，涉及到銀行保函的轉開，只能建行操作。
通過擔保公司辦理銀行保函不需要存全額保證金，只需要繳納很低一部分費用即可。銀行保函辦理周期更長，費用相對更高。擔保公司保函出函速度更快，費用低，辦理靈活。
商業保函（又稱擔保公司保函）是由具有雄厚實力、完善風險體系、良好信譽的專業工程擔保公司開立的保函，與銀行保函保證的內容和承擔的責任一致。
按照開出主體不同，一般分為商業保函和銀行保函。銀泰工程擔保可以辦理商業保函以及銀行保函。擔保公司保函和銀行保函主要區別有：
1、銀行保函是銀行信用，商業保函是商業信用。
2、銀商業保函多用于國際貿易，用于國際擔保業務。而商業保函多用于國內公司。
3、商業保函對比銀行保函資料簡單，辦理速度快，費用更低。
4、商業保函格式條款等更加靈活，銀行保函格式相對固定不易修改。
5、商業保函可以修改保函開具日期，銀行保函不接受修改。
銀行保函對企業資質要求高，三級資質履約保函、純采購項目履約保函、民工工資保函、質量保修保函，銀行在出具銀行保函過程中，要求繳納保證金。商業保函和銀行保函起到的法律效力相同，相同條件下，辦理商業保函費用便宜，更加快捷靈活。
商業保函的制度保障和政策支持：
（1）2016年12月27日，為貫徹落實《辦公廳關于清理規范工程建設領域保證金的通知》（國辦發〔2016〕49號）精神，規范建設工程質量保證金管理，住房城鄉建設部、財政部下發了《關于印發建設工程質量保證金管理辦法的通知》（建質〔2016〕295 號），為工程質量保證金管理提供了制度保障； （來源 /xinwen/2017-01/03/content_5156076.htm）
（2）2017年2月12日，《辦公廳關于促進建筑業持續健康發展的意見》，引導承包企業以銀行保函或擔保公司保函的形式，向建設單位提供履約擔保。（來源 /zhengce/content/2017-02/24/content_5170625.htm ）
（3）2017年6月20日，為貫徹落實關于進一步清理規范涉企收費、切實減輕建筑業企業負擔的精神，規范建設工程質量保證金管理，住房城鄉建設部、財政部對《建設工程質量保證金管理辦法》（建質〔2016〕295號）進行了修訂，下發了《關于印發建設工 程質量保證金管理辦法的通知》建質〔2017〕138號； （來源：/xinwen/2017-07/05/content_5208033.htm）
（4）2017年8月2日，《融資擔保公司監督管理條例》，工程保證金大變革，保證金將退出歷史舞臺。（來源：/premier/2017-08/21/content_5219347.htm）
（5）2017年8月21日，國資委與住建部辦公廳聯合下發了《關于進一步推動中央企業工程建設領域保證金保函替代工作有關事項的通知》（國資廳發財管〔2017〕49 號）
（6）2017年9月26日，財政部工業和信息化部下發了《關于公布部門涉企保證金目錄清單的通知》（工信部聯運行〔2017〕236號）
（7）2018年4月4日。辦公廳關于促進建筑業持續健康發展的意見，國辦發〔2017〕19號，意見中第五大點第（九）條明確指出：加強承包履約管理。引導承包企業以銀行保函或擔保公司保函的形式，向建設單位提供履約擔保。
額保證是指保證人對一定期間內連續發生的不特定債權，在限額內承擔保證責任。
額保證合同不是為特定的單筆債權提供個別擔保，而是為可能發生的多筆債權提供整體擔保，因此其獨立于產生單筆債權的基礎交易合同。
額保證涉及三個重要的期間：
一是決算期間。該期間是確定被擔保債權的期間。該期間屆滿后，債權即特定化，保證人在限額內對特定化的債權余額承擔保證責任。該期間自額保證合同生效之日起算，在合同約定之日截止。如無約定或約定不明確，保證人可以隨時書面通知債權人終止合同。保證人對通知送達債權人前發生的債權余額承擔保證責任。
二是清償期間。該期間是保證人清償債務的期間。額保證涉及多筆債權，各筆債權的到期日不盡相同。額保證合同可以約定統一的清償期間。該期間一般自決算期間屆滿之日起算，于最遲到期的單筆債權的履行期屆滿后截止。保證人在該期間內陸續履行保證責任。
三是保證期間。該期間是債權人行使索賠權的期間。如保證人未按約定履行保證責任，則債權人有權在該期間內提出索賠。在當事人未約定保證期間或約定不明確的情形下，如已約定清償期間，則保證期間為清償期間屆滿之日起六個月，如未約定清償期間，則保證期間為決算期間屆滿之日起六個月。需要說明的是，在未約定清償期間的情形下，保證期間兼有清償期間的作用，實務中通常約定，額保證合同項下每筆債權的保證期間單獨計算，自該筆債權履行期屆滿之日起兩年。