冷庫冷藏的烹飪原料和食品都有含有一定的脂肪、蛋白質和淀粉。這些營養成分的存在，會使霉菌和大量繁殖生長。 為做好冷厙衛生管理工作，保證食品和烹飪原料的冷藏質量，就要定期地進行冷厙衛生工作。 冷庫的除霉殺霉與，可先用酸類劑。酸類劑的作用，主要是凝固菌體中的蛋白。常有的劑有乳酸、過氧已酸、漂白粉、福爾馬林等。
存放過魚的冷庫，未經清洗即存放肉、蛋、或水果蔬菜等食品，致使氣味感染而變質。 冷庫通風不暢，溫、濕度過大，致使霉菌大量繁殖，產生霉氣味。 冷庫制冷管道的泄漏，制冷劑(氨)侵蝕到食品中導致異味產生。 冷庫中溫度不下降，致使肉品變質腐壞產生腐敗味。這種情況多發生在鮮肉未凍結、凍透即轉庫貯藏。 不同氣味的食品存在一個冷庫庫房內，導致食品串味互相感染。
冷藏保鮮只是通過低溫降低生鮮食品、農作物、種子果實等的生命活動，延長其鮮度保質期，這時候食品的生命活動還是有的，只是很微弱了。保鮮食品要用哪種冷庫，就要看食品的特性了。例如：水果、蔬菜等更適宜選用冷藏保鮮庫，肉類、海鮮可選用冷凍保鮮庫。
建造冷庫的長寬高，也就是冷庫體積，有多少立方。建造冷庫，一般來說，是越大價格越高。冷庫建造的越大，所需材料越多，對機組的要求也越高，因此，冷庫造價也就越高。