從胸鰭來看 雌魚的胸鰭呈圓形較大；雄魚的胸鰭粗壯而強硬，胸鰭端部略小而稍圓。此外，在性成熟階段，可從胸鰭邊緣條上有無“追星”來檢查，用手撫摩鰭條，如有粗糙的角質狀凸起者為雄魚，光滑者為雌魚。
錦鯉主要觀賞背面，所以選擇上下較扁、剖面是扁橢圓形、整體呈紡錘形的，而色彩則根據培育目的來選擇相應體色的親魚。例如，要培養紅白錦鯉，就應從紅白品系中選擇健康的雌、雄魚作親魚。如果在培養繁殖用錦鯉時，將不同品系親魚放在一口大魚塘中任其自然繁殖，這樣顯然不能獲得滿意的結果。
同時將雄魚的精液擠于其上，用過的羽毛輕輕攪拌，使之授精，2分鐘～3分鐘后，即將受精卵均勻地倒入預先置于淺水臉盆的魚巢上，靜置十幾分鐘后待受精卵粘固，用清水洗去精液，即可進行孵化。
紅白系錦鯉中應淘汰紅斑紋顏色淡的個體；黃金系錦鯉頭部無光澤、鱗片覆蓋不好、魚體雜斑多、胸 鰭生長不好的個體均應淘汰。錦鯉在飼養過程中淘汰率很高：親魚產10萬粒卵，獲仔魚6萬尾～7萬尾，夏花3萬尾，經次挑選剩1.6萬尾，到秋季越冬時只剩3600尾左右。