首先是建立日常保管制度：
（一）公司印章采取分級保管的制度，各類印章由各崗位專人依職權需要領取并保管。
（二）印章必須由專門保管人妥善保管，不得擅自委托他人保管并在其崗位職責中予以明確。
（三）公章應妥善保管，注意，防止損毀、遺失和被盜。
其次是明確保管人責任：
（一）印章保管人必須妥善保管印章，不得遺失。如遺失，必須及時向公司辦公室報告；
（二）必須嚴格依照公司對印章的使用規定使用印章，未經規定的程序，不得擅自使用；
（三）在使用中，保管人對文件和印章使用單簽署情況予以審核，同意的則用印，否決的則退回；
（四）檢查印章使用是否與所蓋章的文件內容相符，如不符則不予蓋章；
（五）在印章使用中違反規定，給公司造成損失的，由公司對違紀者予以處分，造成嚴重損失或情節嚴重的，移送有關機關處理。
一般情況下是有效的。特殊情況是有約定合同生效需簽字并蓋章。《合同法》第三十二條規定：當事人采用合同書形式訂立合同的，自雙方當事人簽字或者蓋章時合同成立。因為法定代表人以公司名義從事民事活動時代表公司，因此僅有法定代表人簽字也能使合同成立生效。同理，雖然沒有加蓋公章，但如果在合同上簽字的人得到了公司相應的授權，那么合同一樣是有效的。
鋼印：適用于各種證件，如工作證等。 日期印章：又叫號碼章，特殊印章架結構使其號碼或日期可以變動，適用于銀行用章，檢驗用章等日期或號碼需變動的印章。其號碼及章面有金屬、膠皮兩種。
在法律實踐中，公司股東常常因為爭奪公司控制權而對公司印章占有和使用產生爭議，甚至為此反目成仇。公司股東認為公司印章的持有人可能損害公司利益的，只能依照公司法和公司章程的有關規定，依法召開股東會臨時會議，以股東會決議的形式，更換公司法定代表人，進而產生新的公司印章持有人。