有些地區根本無法應用某些技術而迫使國際快遞全系統水平的下降；不同國家不同標準，也造成國際間“接軌”的困難，因而使國際快遞系統難以建立；不同國家的風俗人文也使國際快遞受到很大局限。
國際快遞運輸是國家與國家、國家與地區之間的運輸，一般來說，運輸的距離都比較長，往往需要使用多種運輸工具，通過多次裝卸搬運，要經過許多中間環節，如轉船、變換運輸方式等，經由不同的地區和國家，要適應各國不同的法規和規定。
國際快遞運輸的時間性強。按時裝運進出口貨物，及時將貨物運至目的地，對履行進出口貿易合同，滿足商品競爭市場的需求，提高市場競爭能力，及時結匯，都有著重大意義。特別是一些鮮活商品、季節性商品和敏感性強的商品，更要求迅速運輸，不失時機地組織供應，才有利于提高出口商品的競爭能力，有利于鞏固和擴大銷售市場。
國際快遞運輸的風險較大。由于在國際快遞運輸中環節多，運輸距離長，涉及的面廣，情況復雜多變，加之時間性又很強，在運輸沿途國際形勢的變化、社會的動亂，各種自然災害和意外事故的發生，以及戰亂、封鎖禁運或海盜活動等，都可能直接或間接地影響到國際快遞運輸，以至于造成嚴重后果，因此，國際快遞運輸的風險較大。
