早在 2006 年北京協和醫院在國內率先設立痛風專科門診，曾學軍教授曾先后組織并參與多個降尿酸的上市前后研究。課題組是國內蕞早開展規范化關節穿刺核實臨床診斷痛風的團隊，多次獲得行業基金等項目支持開展高尿酸血癥和痛風的相關研究，開展流行病學、醫生診療行為醫學、疾病治 療規范制訂與推廣、以及衛生經濟學等研究。
在醫療實踐的同時，曾學軍教授致力于臨床醫學教育，任美國內科醫師學會（ACP）Fellow、美國醫學研究所（IOM）中國醫學教育代表。曾榮獲北京市高等教育改革二等獎、 “住院醫師心中好老師”、北京市師德先進個人、北京協和醫學院教學名師等榮譽，帶領普通內科獲得2015年北京協和醫學院教學團隊稱號。2019年2月入選十大社區健康促進首 席專家。
面對眾多前來求助的風濕病患者，北京協和醫院風濕免疫科緊抓高質量醫療服務不放松。針對門診及住院患者中的疑難病例，科室每周組織專業組查房進行集中會診；陸續開展線上診療、視頻三級查房，確保患者就醫的連續性；建立完善多個專病門診，縮短患者診療周期，改善患者就診體驗……
重視科研是協和風濕免疫科的傳統。科室1979年起就率先在全國進行自身抗體檢測的研究。1988年，“抗核抗體譜的建立及臨床應用研究”獲國家科技進步三等獎；1995年，“原發性干燥綜合征的系列研究”獲國家科技進步三等獎；近年來，獲北京市科學技術獎、中華醫學科技獎、華夏醫學科技獎等省部級獎項共計13項。
