北京兒童醫院共有在職職工3210人，其中醫生968人，護士1325人，醫技462人。正高級職稱292人，副高級職稱380人，中級職稱692人。醫院擁有中國現代兒科學奠基人諸福棠、中國兒童血液腫瘤學開創者胡亞美、中國小兒外科創始人之一張金哲等國內兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻專家、享受政府特殊津貼人員、新世紀百千萬人才工程人選、國家杰出青年科學基金獲得者等眾多高層次人才。
年來，為方便患者就醫，北京兒童醫院始終堅持24小時接診。醫院積極踐行公立醫院改革，推進預約掛號工作，優化服務流程，改善患者就醫體驗，受到國家衛生健康委的肯定和廣大群眾的認可。醫院還承擔了上級部門委派的重大兒童傳染病防治、抗震救災支援、突發公共衛生事件救治等醫療任務。
北京兒童醫院醫院內分泌科開設肥胖與減重門診，篩查導致肥胖的內分泌疾病(如垂體、腎上腺、甲狀腺疾病、下丘腦綜合征等)，評估營養狀況，進行營養代謝狀態分析，并對患者進行個體化減重指導，幫助患者達到并維持目標體重。
鞏純秀，中華醫學會兒科內分泌遺傳代謝學組副組長，中華醫學會糖尿病學會委員，中華醫學會糖尿病學會1型糖尿病學組副組長，北京醫學會兒科分會內分泌遺傳代謝學組組長，中華醫學會糖尿病學分會北京分會委員，原亞太兒科內分泌學會理事會理事，中國醫師協會內分泌代謝學分會常委。中華兒科雜志編委,中華醫藥雜志常務編委，中華糖尿病雜志編委，中國糖尿病雜志編委，中國實用兒科雜志編委，中國小兒急救醫學編委，免疫分析與臨床雜志編委，柳葉刀糖尿病內分泌中文版編委。
