早在 2006 年北京協和醫院在國內率先設立痛風專科門診，曾學軍教授曾先后組織并參與多個降尿酸的上市前后研究。課題組是國內蕞早開展規范化關節穿刺核實臨床診斷痛風的團隊，多次獲得行業基金等項目支持開展高尿酸血癥和痛風的相關研究，開展流行病學、醫生診療行為醫學、疾病治 療規范制訂與推廣、以及衛生經濟學等研究。
曾學軍教授參與了國內目前所有關于痛風和高尿酸血癥指南的制定工作， 2013 年牽頭制定了《高尿酸血癥社區管理規范草案》，2018年11月在中華全科醫師雜志上發表修訂版《高尿酸血癥社區管理流程的專家建議》，2020年4月再次牽頭制定《痛風及高尿酸血癥基層診療指南》。
2020年8月，北京協和醫院風濕免疫科實驗室完成了靶抗原特異性標志物的全部項目方法學升級，由傳統手工、批量操作、定性檢測的酶聯免疫吸附測定（ELISA）升級為全自動、實時進樣、高通量、定時檢測的化學發光檢測方法，可檢測自身抗體60余種。這也是國內三甲醫院第 一條專門用于自身抗體檢測的全自動流水線，日運行通量可達1.5萬次。報告時間縮短到0.5至1個工作日，為患者的精 準診斷提供了重要支撐。
重視科研是協和風濕免疫科的傳統。科室1979年起就率先在全國進行自身抗體檢測的研究。1988年，“抗核抗體譜的建立及臨床應用研究”獲國家科技進步三等獎；1995年，“原發性干燥綜合征的系列研究”獲國家科技進步三等獎；近年來，獲北京市科學技術獎、中華醫學科技獎、華夏醫學科技獎等省部級獎項共計13項。
