北大醫院前身為北京醫科專門學校附設診察所，后陸續更名為北京醫科大學校附屬醫院、北平大學醫學院附屬醫院等。1946年，醫院隨北平大學醫學院并入北京大學，由此得名“北大醫院”。1952年，全國高等學校院系調整，北京大學醫學院獨立建院，設立北京醫學院，后又更名為北京醫科大學，醫院隨之先后更名為北京醫學院附屬醫院、北京醫學院第 一醫院、北京醫科大學第 一醫院。2000年，北京大學與北京醫科大學再次合并，醫院隨之更名為“北京大學第 一醫院”。2008年，醫院成為中央保健基地醫院。
北大醫院學科齊全，綜合實力居于國內前列、國際一 流，臨床醫學一級學科整體進入國家雙建設學科范圍?，F有4個教育部重點學科（牽頭），1個國家中醫藥管理局重點學科（牽頭），3個北京市重點學科（牽頭），7個教育部重點學科（參與）；獲批國家臨床重點?？平ㄔO項目29次，覆蓋25個學科。
北京大學第 一醫院積極拓展互聯網醫療、遠程醫療服務，推動實現優質醫療資源共享；探索醫療新技術，年度手術機器人超過千臺，實現跨海超遠程機器人手術。2023年12月18日，醫院大興院區正式投入使用，編制床位1200張，預計日門診量達5000—6000人次/日。大興院區秉持“大?？?、小綜合”發展理念，打造以婦女兒童醫學中心、腫瘤醫學中心、介入中心、內鏡中心、急危重癥搶救中心為戰略支撐點的學科群。
北大醫院因醫學教育而生，始終堅持“立德樹人”根本任務。自1977 年至今，醫院累計培養本科生 3300 余人，研究生 4000 余人，其中包括碩士 2000余人、博士 2000余人。作為首批國家住院醫師規范化培訓示范基地，自2005年至今，累計規范化培訓住院醫師1100余人。現有本科生同期在院440余人，研究生同期在院740余人，畢業后繼續教育900余人。
