曾學軍教授參與了國內目前所有關于痛風和高尿酸血癥指南的制定工作， 2013 年牽頭制定了《高尿酸血癥社區管理規范草案》，2018年11月在中華全科醫師雜志上發表修訂版《高尿酸血癥社區管理流程的專家建議》，2020年4月再次牽頭制定《痛風及高尿酸血癥基層診療指南》。
近年來，得益于國家對風濕免疫病投入逐步增加，在SLE科技支撐計劃/863項目、自身免疫性疾病新藥臨床評價研究技術平臺科技重大專項、衛計委行業科研專項等支持下，以北京協和醫院牽頭，聯合全國近800家風濕病診治中心，已初步形成系統性紅斑狼瘡研究協作組（CSTAR）和國家風濕病數據中心（CRDC）的研究網絡，成為國內的風濕病研究協作組織，創建了中國風濕病信息數據庫、生物樣本庫（CRIP）和規范化培訓和多學科交流平臺（CREP），啟動了中國風濕病學界的多中心協作研究，發布了中國風濕病學界的規范化診治共識。
北京協和醫院風濕免疫科從建科時僅有3張病床的小科室發展到今天，協和風濕免疫科已擁有68張病床，年收治患者1500例次以上，年門診量逾12萬人次，不僅注重系統性紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風濕關節炎、強直性脊柱炎等常見風濕性疾病的規范診治，更強調對少見風濕性疾病、風濕性疾病重要臟器損害以及風濕性疾病嚴重并發癥的綜合診治，追求更精 確的診斷、更細致的評估、更有效的治 療效果。
重視科研是協和風濕免疫科的傳統。科室1979年起就率先在全國進行自身抗體檢測的研究。1988年，“抗核抗體譜的建立及臨床應用研究”獲國家科技進步三等獎；1995年，“原發性干燥綜合征的系列研究”獲國家科技進步三等獎；近年來，獲北京市科學技術獎、中華醫學科技獎、華夏醫學科技獎等省部級獎項共計13項。
