曾學軍教授參與了國內目前所有關于痛風和高尿酸血癥指南的制定工作， 2013 年牽頭制定了《高尿酸血癥社區管理規范草案》，2018年11月在中華全科醫師雜志上發表修訂版《高尿酸血癥社區管理流程的專家建議》，2020年4月再次牽頭制定《痛風及高尿酸血癥基層診療指南》。
在醫療實踐的同時，曾學軍教授致力于臨床醫學教育，任美國內科醫師學會（ACP）Fellow、美國醫學研究所（IOM）中國醫學教育代表。曾榮獲北京市高等教育改革二等獎、 “住院醫師心中好老師”、北京市師德先進個人、北京協和醫學院教學名師等榮譽，帶領普通內科獲得2015年北京協和醫學院教學團隊稱號。2019年2月入選十大社區健康促進首 席專家。
北京協和醫院風濕免疫科作為我國風濕學病專業發展與人才培養的蕞早基地之一，自1980年建科歷經四十多年風雨，集醫療、科研、教學為一體，不斷提高風濕病學診斷水平，推動國內風濕病學的發展。科室樹立了以科研為，教學為基礎，醫療為根本的發展理念開展工作。目前全科46人，其中老專家3人，現有國家人事部留學歸國人員科研基金（包括海外）獲得者4人，政府特貼專家人3人，主任醫師11人，博士生導師12人，副主任醫師10人，碩士生導師12人，高級職稱24人，中級15人，以及各類專業技術人員22人。臨床40歲以下的青年醫師中100％具有博士學位，80%具有在西方發達國家實驗室工作進修的經歷。目前有10位在全國學會任職包括中華醫學會風濕病學分會主任委員、侯任主任委員以及中國醫師協會風濕免疫科醫師分會會長、副會長等，北京醫學會任職10人。科室年門診量超過13萬人次，床位68張，為全國各地的危重疑難風濕病人服務。
2020年8月，北京協和醫院風濕免疫科實驗室完成了靶抗原特異性標志物的全部項目方法學升級，由傳統手工、批量操作、定性檢測的酶聯免疫吸附測定（ELISA）升級為全自動、實時進樣、高通量、定時檢測的化學發光檢測方法，可檢測自身抗體60余種。這也是國內三甲醫院第 一條專門用于自身抗體檢測的全自動流水線，日運行通量可達1.5萬次。報告時間縮短到0.5至1個工作日，為患者的精 準診斷提供了重要支撐。
