曾學軍教授參與了國內目前所有關于痛風和高尿酸血癥指南的制定工作， 2013 年牽頭制定了《高尿酸血癥社區管理規范草案》，2018年11月在中華全科醫師雜志上發表修訂版《高尿酸血癥社區管理流程的專家建議》，2020年4月再次牽頭制定《痛風及高尿酸血癥基層診療指南》。
近年來，得益于國家對風濕免疫病投入逐步增加，在SLE科技支撐計劃/863項目、自身免疫性疾病新藥臨床評價研究技術平臺科技重大專項、衛計委行業科研專項等支持下，以北京協和醫院牽頭，聯合全國近800家風濕病診治中心，已初步形成系統性紅斑狼瘡研究協作組（CSTAR）和國家風濕病數據中心（CRDC）的研究網絡，成為國內的風濕病研究協作組織，創建了中國風濕病信息數據庫、生物樣本庫（CRIP）和規范化培訓和多學科交流平臺（CREP），啟動了中國風濕病學界的多中心協作研究，發布了中國風濕病學界的規范化診治共識。
北京協和醫院風濕免疫科被業界稱為中國風濕病學科的“黃埔軍校”。1979年，在“中國風濕病學之父”張乃崢教授的帶領下，北京協和醫院成立了中國蕞早的風濕免疫學組，翻開了中國風濕病學事業的嶄新篇章。四十余年來，在幾代協和風濕免疫人的辛勤奮斗下，科室蓬勃發展，引領并見證了我國風濕病學事業從無到有、自小變大、由弱變強。
2020年8月，北京協和醫院風濕免疫科實驗室完成了靶抗原特異性標志物的全部項目方法學升級，由傳統手工、批量操作、定性檢測的酶聯免疫吸附測定（ELISA）升級為全自動、實時進樣、高通量、定時檢測的化學發光檢測方法，可檢測自身抗體60余種。這也是國內三甲醫院第 一條專門用于自身抗體檢測的全自動流水線，日運行通量可達1.5萬次。報告時間縮短到0.5至1個工作日，為患者的精 準診斷提供了重要支撐。
