投標保函辦理手續費（銀行保函）得根據辦理方式來定，如果企業自己去銀行辦理，交全額保證金，然后按照季度交手續費，大概在幾百塊不等，還有一種方式是通過占用第三方擔保公司在銀行的額度出的保函（分離式保函），這種保函跟企業自己去出保函效果一樣，出的保函上不體現擔保公司，只體現受益人、申請企業、項目名稱、保函金額和期限等信息，這種費用也是幾百塊，但是不用交保證金。
預付款保函,又稱還款保函，指擔保人(銀行)根據申請人(合同中的預收款人，通常情況下是出口商)的要求向受益人(合同中的預付款人，通常是進口商)開立的，保證一旦申請人未能履約，或者未能全部履約，將在收到受益人提出的索賠后向其返還該預付款的書面保證承諾。
履約保函是指應勞務方和承包方(申請人)的請求，銀行金融機構向工程的業主方(受益人)做出的一種履約保證承諾。如果勞務方和承包方日后未能按時、按質、按量完成其所承建的工程，則銀行將向業主方支付一筆約占合約金額5%~10%的款項。履約保函有一定的格式限制，也有一定的條件。
商業保函指的是，除了銀行以外，由其他商業機構出具的保函，一般出具保函的公司都是專業的擔保機構或商業機構的信用擔保。
商業保函也是包括了很多種的，比如預付款保、農民工工資支付保函、質量保函、投標保函、履約保函等，這些都是屬于商業保函。
商業保函的費用相對于銀行辦函要便宜很多，有的可能低于50%以上。這對于建筑企業來說，相對還是比較節約成本的。