土雞的疾病按其發生原因不同，一般可分為傳染病寄生蟲和普通病三大類傳染病是由―定的病原微生物（病毒等）侵入雞體內生長繁殖，破壞雞的機體正常生理功能 并能在雞群中廣泛傳播，引起其他易感雞發生相同疾病的一類疾病，如雞新城疫、禽霍亂等。寄生蟲病是由某種寄生蟲侵襲雞體后引起的疾病，也能在雞群中傳播、蔓延，使其他健康雞發病，如球蟲病、住白蟲病等。
普通病是由各種刺激物的作用以及飼料中某些營養素的缺乏或含有某種有毒物質而引起的疾病。普通病不會傳染，但在集中飼養的情況下，可能會造成雞大批發病，如維生素缺乏癥、食鹽中毒、黃曲霉毒素中毒、喹乙醇中毒等