蜂蜜隨蜜源植物種類不同，顏色差別很大。無論是單花還是混合的蜜種，都具有一定的顏色，而且，往往是顏色淺淡的蜜種，其味道和氣味較好。因此，蜂蜜的顏色，既可以作為蜂蜜分類的依據，也可作為衡量蜂蜜品質的指標之一。蜂蜜之間存在著色澤差異，將其分為水白色、特白色、白色、特淺琥珀色、淺琥珀色、琥珀色及深琥珀色7個等級、其區分顏色的依據是普方特比色儀，普方特比色儀讀數分級如下：
水白色 8MM
特白色 8～17MM
白色 17～34MM
特淺琥珀色 34～50MM
淺琥珀色 50～85MM
琥珀色 85～114MM
深琥珀色 114～140MM