程序麻將機運行原理分為以下幾個部分:控色線圈、光控鏡頭、程序主板。三大部分組成。
控色部分，控色線圈。控色線圈又分為兩個部分組成，一是磁線圈，用于控制色子點數，通過電生磁原理產生吸力，控制色子點數。二是充電線圈，給色子充電。
光控鏡頭部分，款程序麻將無需換牌，只需安裝4個鏡頭，通過光控鏡頭將掃描到的麻將轉換成電信號發送給程序主板，程序主板接收到信號按照預定設置好的麻將玩法比如(紅中，血戰，宜昌麻將等)，來選定好牌，計算色子。
主板部分，程序麻將的主板是整個程序的心臟，主板控制著控色部分，光控鏡頭，打色盤電源線，變壓器轉換線。