牛皮紙檔案盒在檔案管理領域具有諸多顯著優勢。在保護檔案方面，其采用的牛皮紙材質，尤其是無酸紙，能有效抵御外界環境對檔案的侵蝕。不含酸性物質，避免了檔案文件因酸性腐蝕而發黃、變脆，防蟲、防霉特性也能防止檔案被蟲蛀、發霉，程度地延長檔案的保存期限。
從環保角度看，牛皮紙屬于可回收利用的材料，在檔案盒使用壽命結束后，可通過專業回收渠道進行回收處理，重新加工成紙張或其他紙制品，減少了資源浪費和環境污染。相比塑料等不可降解材料制作的檔案盒，牛皮紙檔案盒更符合現代環保理念。
在成本效益方面，牛皮紙檔案盒價格相對親民，制作工藝相對簡單，原材料成本較低。同時，其堅固耐用的特性，減少了因頻繁更換檔案盒而產生的成本，長期來看，為檔案管理節省了大量資金。此外，牛皮紙檔案盒的尺寸和種類豐富，能滿足不同檔案的存儲需求，提高了檔案管理的效率和便捷性。