民航快遞燃油附加費沒有統一固定的收費標準，由各大航空公司根據自身運營成本、航線距離、油價走勢等因素自主制定，其收費方式主要有以下兩種：
按重量計費：這是最常見的收費方式，以貨物的 “計費重量” 為基數，按 “每公斤多少金額” 收取。例如某航司的中美航線燃油附加費為 5 元 /kg，若貨物計費重量為 100kg，則需支付 500 元燃油附加費。一般來說，短航線如中國 - 日本，燃油附加費可能為 2-5 元 /kg；長航線如中國 - 巴西，燃油附加費可能高達 15-25 元 /kg。
按運費百分比計費：以貨物的 “基礎運費” 為基數，按一定百分比收取。例如某航司規定燃油附加費為基礎運費的 15%，若基礎運費為 1000 元，則燃油附加費為 150 元。這種方式多適用于高價值貨物、包機運輸等場景。
此外，部分航司對超大、超重貨物，如單件重量超 100kg，會按 “更高比例” 或 “固定費率” 收取燃油附加費，危險品、冷鏈貨物等特殊品類，也可能因運輸要求特殊，適用更高的燃油附加費標準。燃油附加費的調整周期通常為每月，也可能在油價波動劇烈時縮短至每周。