預付款保函索賠期限延長需要繳納費用。因為期限延長屬于保函修改的范疇，會增加擔保人的擔保風險和責任周期，銀行等擔保人通常會按一定標準收取費用，具體收費規則因銀行政策、保函金額等有所差異，以下是詳細說明：
費用計收標準有明確依據：多數銀行會按原預付款保函的費率，結合修改當日的保函余額以及延長的期限來計收費用。比如樂山市商業銀行就規定，預付款保函作為非融資性保函，效期延長時，延長的期限按原保函費率和修改日保函余額計收，且擔保期限不足一季的按一季收取。同時，部分銀行還會額外收取保函修改的基礎手續費，不過這部分費用和期限延長的核心費用是分開核算的。
費用核算的影響因素：費用金額主要受兩個核心因素影響。一是保函余額，余額越高，按比例計收的費用自然越多；二是延長期限，延長時間越長，費用累計也會相應增加。此外，申請人的信用狀況也可能間接影響，若申請人資信良好，或許能和銀行協商到更優惠的費率；若資信一般，銀行可能會維持基準費率甚至小幅上浮以覆蓋風險。
費用繳納的時間節點：通常在辦理延期手續時需一次性繳清相關費用，銀行在收到費用并完成審核后，才會正式出具保函延期通知書或簽訂保函修改協議，確保延期生效。若未按時繳納費用，銀行可能會駁回延期申請，導致原保函到期后自動失效。